docs(update):更新Project Caffeine项目变更日志文档(arabica v0.0.3版本更新）

Signed-off-by: gzkoala <guohao@gitconomy.org>

CHANGELOG.md

@@ -3,10 +3,10 @@
 title: Project Caffeine Changelog (更新日志)
 description: 记录 Project Caffeine 项目的所有显著更改、版本迭代与发布历史，遵循 Keep a Changelog 与语义化版本规范。
 type: Changelog
-version: v0.1.1 (Arabica) - Sprint 2
+version: v0.0.3 (Arabica) - Sprint 3
 file: CHANGELOG.md
 author: Gitconomy Research-郭晧
-date: 2026-03-07
+date: 2026-03-11
 tags:
   - Project Caffeine
   - Changelog
@@ -24,7 +24,43 @@ status: Active
 
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-## [0.1.1] - 2026-03-06
+## [0.0.3] - 2026-03-10
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+### Added (新增)
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+- **意图驱动路由引擎**：全面重构系统提示词，确立四大核心意图映射（文献查询、框架分析、保存内容、本地笔记分析），使大模型能够根据自然语言智能调度专属工具。
+- **学术文献检索接入**：新增 `search_arxiv` 原子工具与 `arxivService.ts`，支持基于提取的核心关键字调用 Arxiv API，实时获取学术论文并结构化输出。
+- **结果落盘持久化**：优化 `save_note` 工具，允许大模型在获取用户明确授权后，将生成的长篇分析报告或检索结果一键保存为本地 Markdown 文件。
+- **内部模板获取工具**：新增 `fetch_framework_template` 后台工具，专供大模型内部读取 SWOT、SCQA 等 JSON 框架配置，不再向客户端 UI 暴露。
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+### Changed (变更)
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+- **系统架构降维升级**：系统架构从“UI 按钮/提示词驱动（Prompt-driven）”彻底转向“自然语言/工具驱动（Tool-driven）”。
+- **参数宽容度放宽 (Parameter Tolerance)**：将 `save_note` 等工具的核心负载参数类型校验由严格的 `z.string()` 放宽至 `z.any()`，并在底层 `toolsController.ts` 中引入自动序列化机制（`JSON.stringify`），以承接大模型输出的畸形对象。
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+### Deprecated (废弃)
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+- **MCP Prompts 原语暴露**：废弃了向客户端 UI 直接暴露的 `prompts/list` 和 `prompts/get` 接口，改由大模型在后台自主调用工具获取模板。
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+### Removed (移除)
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+- 移除了 Sprint 2 时期遗留的 5 个硬编码 `server.prompt` 注册代码。
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+### Fixed (修复)
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+- **大模型 JSON 转义崩溃**：彻底修复了因大模型未能正确转义超长 Markdown 文本和嵌套引号，导致底层触发 `AI_JSONParseError` 并中断工具调用的核心故障。
+- **无限循环调用死锁 (Infinite Tool Call Loop)**：修复了大模型在读取原始 JSON 框架文件后由于“困惑”而导致的工具循环调用崩溃；通过在 `toolsController.ts` 中剥离 JSON 外壳，并向大模型强制注入“🛑立即停止调用任何工具”的底层防呆指令解决。
+- **TypeScript 强类型推断错误**：修复了 MCP SDK 中因 `type` 字段推断为泛用 `string` 而引发的编译报错，通过显式声明 `type: "text" as const` 解决。
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+### Security (安全)
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+- **强指令防越权写入**：在系统提示词与底层逻辑中双重加固防线，设定【绝对红线】，严禁大模型在未经主动提问并获取用户明确（如“是”、“保存”）授权前，私自调用 `save_note` 执行写盘操作。
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+
+
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+## [0.0.2] - 2026-03-06
 
 ### Added (新增)
 
@@ -59,7 +95,7 @@ _(无)_
 
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-## [0.1.0] - 2026-03-03
+## [0.0.1] - 2026-03-03
 
 ### Added (新增)